Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pkn1P70268 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pkn1P70268 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pkn1P70268 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pkn1P70268 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms