Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpfP62307 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms