Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms