Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms