Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms