Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ItgavP43406 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ItgavP43406 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ItgavP43406 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ItgavP43406 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ItgavP43406 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ItgavP43406 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ItgavP43406 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ItgavP43406 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ItgavP43406 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ItgavP43406 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms