Protein–RNA interactions for Protein: P39688

Fyn, Tyrosine-protein kinase Fyn, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FynP39688 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FynP39688 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FynP39688 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FynP39688 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FynP39688 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FynP39688 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FynP39688 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FynP39688 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FynP39688 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FynP39688 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FynP39688 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FynP39688 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FynP39688 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FynP39688 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FynP39688 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FynP39688 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FynP39688 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FynP39688 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FynP39688 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FynP39688 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FynP39688 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FynP39688 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FynP39688 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FynP39688 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FynP39688 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FynP39688 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FynP39688 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FynP39688 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FynP39688 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FynP39688 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FynP39688 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms