Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms