Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms