Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cd28P31041 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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