Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccnd3P30282 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms