Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pabpc1P29341 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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