Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afxP27661 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2afxP27661 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms