Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UbtfP25976 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UbtfP25976 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
UbtfP25976 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UbtfP25976 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms