Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18530 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18530 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms