Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms