Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms