Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
P10404 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
P10404 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
P10404 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
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