Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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