Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt1O88346 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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