Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Col5a1O88207 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Col5a1O88207 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Col5a1O88207 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Col5a1O88207 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Col5a1O88207 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Col5a1O88207 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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