Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ldb2O55203 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ldb2O55203 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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