Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Sp100O35892 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Sp100O35892 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Sp100O35892 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sp100O35892 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sp100O35892 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sp100O35892 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sp100O35892 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sp100O35892 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sp100O35892 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Sp100O35892 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Sp100O35892 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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