Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited2O35740 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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