Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms