Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cldn4O35054 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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