Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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