Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d1O08532 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d1O08532 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d1O08532 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d1O08532 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d1O08532 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d1O08532 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d1O08532 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d1O08532 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d1O08532 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d1O08532 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d1O08532 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d1O08532 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d1O08532 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms