Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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