Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn34c2J3QNM1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn34c2J3QNM1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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