Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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