Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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