Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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