Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms