Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SafbD3YXK2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SafbD3YXK2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SafbD3YXK2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SafbD3YXK2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SafbD3YXK2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SafbD3YXK2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SafbD3YXK2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SafbD3YXK2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SafbD3YXK2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SafbD3YXK2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SafbD3YXK2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms