Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol6B7ZC55 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms