Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp26c1B2RXA7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp26c1B2RXA7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms