Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Znf518bB2RRE4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Znf518bB2RRE4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Znf518bB2RRE4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Znf518bB2RRE4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Znf518bB2RRE4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Znf518bB2RRE4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Znf518bB2RRE4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Znf518bB2RRE4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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