Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Krtap1-3A2A588 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms