Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt27Q9Z320 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt27Q9Z320 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt27Q9Z320 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt27Q9Z320 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt27Q9Z320 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt27Q9Z320 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt27Q9Z320 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt27Q9Z320 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt27Q9Z320 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms