Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms