Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms