Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Tgm1Q9JLF6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Tgm1Q9JLF6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Tgm1Q9JLF6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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