Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms