Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms