Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms