Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms