Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms