Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Gtf3c6Q9D8P7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Gtf3c6Q9D8P7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gtf3c6Q9D8P7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gtf3c6Q9D8P7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gtf3c6Q9D8P7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gtf3c6Q9D8P7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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