Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms